Na minha opinião são ambas boas marcas, se bem que eu gosto mais da Iomega. Tenho um colega que "colecciona" discos externos da Iomega, e nunca deram problemas. Aliás, quase todas as pessoas que conheço que têm discos externos (incluindo eu), têm, pelo menos, um disco Iomega, e nunca ouvi dizer mal deles.
Por outro lado, da Western Digital, não gosto nada da gama MyBook. Os preços são baixos, isso é verdade, mas deixam muito a desejar... Não têm especificações técnicas nenhumas, nem na caixa, nem dentro dela, e penso que também não têm no site. E nota-se a olho que são mais lentos que o normal.
No caso desses dois, mais uma vez, a WD perde por não ter indicadas as especificações técnicas do disco. A Iomega diz a cache, as RPM... Para além de ser mais barato e ter mais espaço.